杜克大学的科学家们已经开发出一种基于RNA的编辑工具,针对单个细胞,而不是基因。它能够精确瞄准任何类型的细胞,并有选择地添加任何感兴趣的蛋白质。研究人员说,该工具可以使修改非常具体的细胞和细胞功能来管理疾病。
由神经生物学家Z. Josh Huang博士和博士后研究员Yongjun Qian博士领导的团队使用一种基于RNA的探针,证明了他们可以将荧光标签引入细胞,以标记特定类型的脑组织;一个光敏的开关,以沉默或激活他们选择的神经元;甚至一个自毁酶,以精确清除一些细胞而不是其他。这项工作将于今天(2022年10月5日)发表在《自然》杂志上。
【资料图】
他们的选择性细胞监测和控制系统依赖于ADAR酶,这种酶在每个动物的细胞中都有。虽然这些处于CellREADR(通过内源性ADAR的RNA传感进行细胞访问)的早期阶段,但可能的应用似乎是无止境的,Huang说,它在整个动物界发挥作用的潜力也是如此。
Huang说:"我们很兴奋,因为这提供了一个简化的、可扩展的和可普及的技术,以监测和操纵任何动物的所有细胞类型。我们实际上可以修改特定类型的细胞功能来管理疾病,而不考虑其最初的遗传倾向。这在目前的治疗方法或药物中是不可能的。"
CellREADR是一串可定制的RNA,由三个主要部分组成:一个传感器,一个停止信号,和一套蓝图。
首先,研究小组决定他们要研究的具体细胞类型,并确定由该细胞类型独特产生的目标RNA。该工具显著的组织特异性依赖于这样一个事实,即每种细胞类型都会产生其他细胞类型所没有的标志性RNA。
然后设计一个传感器序列作为目标RNA的互补链。就像DNA上的梯子是由互补分子组成的,它们本身就相互吸引,RNA也有同样的表现类似磁性的特性,如果它有匹配的分子,就能与另一块RNA连接。
在一个传感器进入细胞并找到其目标RNA序列后,两片RNA会粘在一起,形成一片双链RNA。这种新的RNA混杂物触发了ADAR酶来检查新的创造物,然后改变其代码的一个核苷酸。
ADAR酶是一种细胞防御机制,旨在当双链RNA发生时对其进行编辑,并被认为存在于所有动物细胞中。
了解到这一点后,Qian利用ADAR在双链RNA中编辑的相同特定核苷酸设计了CellREADR的停止标志。只有当CellREADR的传感器与它的目标RNA序列对接时,阻止蛋白质蓝图被构建的停止标志才会被移除,这使得它对特定的细胞类型具有高度的特异性。
一旦ADAR移除停止标志,蓝图就可以被细胞机器读取,在目标细胞内构建新的蛋白质。
在他们的论文中,Huang和他的团队让CellREADR经历了它自己的磨练。"我记得两年前,当Yongjun建立了CellREADR的第一个迭代并在小鼠大脑中进行测试时,"Huang说。"令我惊讶的是,他第一次尝试就取得了惊人的效果。"
该团队的精心策划和设计得到了回报,因为他们随后能够证明CellREADR准确地标记了活体小鼠的特定脑细胞群,以及有效地添加了活动监视器和控制开关的指示。它在大鼠和从癫痫手术中收集的人类脑组织中也运作良好。
"有了CellREADR,我们可以挑选人群进行研究,并真正开始研究人脑中存在的全部细胞类型,"共同作者Derek Southwell博士说,他是一名神经外科医生和杜克大学神经外科部门的助理教授。
Southwell希望CellREADR将提高他和其他人对人类大脑电路和其中细胞的布线图的理解,并在这样做的过程中,帮助推进神经系统疾病的新疗法,例如他正在试验的一种治疗耐药性癫痫的有希望的新方法。
Huang和Qian对CellREADR作为"可编程RNA药物"可能治愈疾病的潜力特别有信心和希望,因为这正是吸引他们俩从事科学工作的初衷。他们已经为该技术申请了专利。
"当我在本科时主修药理学时,我非常天真,"Qian说。"我以为可以做很多事情,比如治愈癌症,但实际上这非常困难。然而,现在我想,是的,也许我们可以做到。"
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