一项将长毛象基因组与现代大象进行比较的研究揭示了定义该物种的关键特征,如毛茸茸的毛皮、大量脂肪沉积和小耳朵。这些特征在早期的长毛象中已经存在,并在它们70多万年的生存过程中变得更加明确。
一个研究小组比较了长毛象和现代大象的基因组,以找出是什么使长毛象作为个体和物种变得独特。调查人员今天(4月7日)在《当代生物学》杂志上报告说,长毛象的许多标志性特征--包括它们的毛大衣和大量的脂肪沉积--在最早的长毛象中已经有了基因编码,但是这些特征和其他特征在这个物种70多万年的存在中变得更加明确。他们还确定了一个有几个突变的基因,这些突变可能是造成长毛象微小耳朵的原因。
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斯德哥尔摩古遗传学中心的古遗传学家和第一作者David Díez-del-Molino说:"我们想知道是什么让猛犸象成为一头长毛猛犸象。长毛猛犸象有一些非常有特点的形态特征,比如它们厚厚的皮毛和小耳朵,显然可以根据冷冻标本的样子来预期,但是还有许多其他的适应性,比如脂肪代谢和寒冷感知,这些都不是那么明显,因为它们是在分子水平上。"
这是一张毛猛犸象牙的照片,作者对其进行了整个基因组的测序。这根长毛象牙于2015年在西伯利亚东北部被发现,并被放射性碳测定为距今约18,000年。
为了确定在长毛象中"高度进化"的基因--意味着它们积累了大量的突变--研究小组将23只西伯利亚长毛象的基因组与28只现代亚洲和非洲大象的基因组进行了比较。这些长毛象中有22只是相对现代的,生活在过去10万年内,其中16只的基因组以前没有被测序过。第二十三只长毛象的基因组属于已知最古老的长毛象之一,Chukochya,它生活在大约70万年前。
高级作者、斯德哥尔摩古遗传学中心进化基因组学教授Love Dalén说:"有了Chukochya的基因组,我们就能确定一些在长毛象作为一个物种的生命周期中进化的基因。这使我们能够实时研究进化,我们可以说这些特定的突变是长毛象所特有的,它们在它的祖先中并不存在。"
这是研究的共同作者Love Dalén与Yuka猛犸象的照片,其基因组被纳入分析。
毫不奇怪,许多对长毛象有适应性的基因都与生活在寒冷环境中有关。这些基因中的一些被不相关的现代北极哺乳动物所共享。Díez-del-Molino说:"我们发现了一些与脂肪代谢和储存有关的高度进化的基因,这些基因在驯鹿和北极熊等其他北极物种中也有发现,这意味着这些基因在适应寒冷的哺乳动物中可能存在趋同进化。"
虽然以前的研究已经考察了一两只长毛象的基因组,但这是第一次比较大量的长毛象基因组。这种大样本量使研究小组能够确定在所有长毛象中常见的基因,因此可能是适应性的,而不是可能只在单个个体中出现的基因突变。
Díez-del-Molino说:"我们发现,一些以前被认为是长毛象的特殊基因实际上在长毛象之间是可变的,这意味着它们可能并不那么重要。"
这是研究的共同作者Marianne Dehasque在斯德哥尔摩古遗传学中心的古代DNA实验室工作的照片。
总的来说,70万年前的Chukochya基因组共享大约91.7%的突变,这些突变引起了更现代的长毛象的蛋白质编码变化。这意味着,当长毛象第一次从其祖先草原猛犸象中分化出来时,许多长毛象的决定性特征--包括厚皮毛、脂肪代谢和寒冷感知能力--可能已经存在。
然而,这些特征在楚科奇亚的后代中得到了进一步发展。"最早的长毛象还没有完全进化,"Dalén说,"它们可能有更大的耳朵,它们的毛也不同--与后来的长毛象相比,也许没有那么绝缘和蓬松。"
更现代的长毛象在T细胞抗原上也有几个免疫突变,这在它们的祖先身上是看不到的。作者推测,这些突变可能赋予了增强的细胞介导的免疫力,以应对新出现的病毒病原体。
与古代猛犸象DNA一起工作,会遇到一系列的障碍。Díez-del-Molino说:"从野外工作到实验室工作,再到生物信息学,每一步都会有一些困难。"
所有基因组被纳入这项研究的猛犸象都是在西伯利亚收集的,但研究人员希望在未来能将北美的长毛象分支出来并进行比较。Dalén说:"我们几年前表明,在长毛猛犸象和哥伦比亚猛犸象的祖先之间存在着基因流动,所以这也是我们需要考虑的问题,因为北美长毛猛犸象可能也携带了非长毛猛犸象的基因。"
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